拟订科技创新发展规划、基础研究规划、政策并协调组织实施；承担科技统计等工作；统筹提出科技资源合理配置的政策措施建议，组织编制实施财政科技计划（专项、基金等）；负责自然科学基金管理相关工作；建立科研项目资金协调、评估、监管工作机制，建设运行科技管理信息系统，指导项目管理专业机构建设和运行；实施科技报告制度；协调推进科技创新体系建设和科技体制改革，拟订科研机构改革发展规划和政策并监督实施；提出重大科技创新基地和科研条件保障建议并监督实施；协调推进科技基础设施建设，统筹布局重点实验室、企业技术研究中心等建设。